Команду последовательно возглавляли: штурмбанфюрер СС Рауш Макс (1941–1942), оберштурмфюрер СС Отт Адольф (1942–1943), штурмбанфюрер СС доктор Аюнгер Йозеф (1942–1943), оберштурмбанфюреры СС Раабе Георг (1943–1944) и Гетцель. Зондеркоманда состояла из штаба и нескольких отрядов, называвшихся по населенным пунктам. В своем составе команда имела 100–120 официальных сотрудников, 30–40 оперативных работников, следователей, переводчиков.

Подразделение команды состояло, как правило, из начальника, его заместителя, 3–4 следователей, 2–3 агентурных работников и нескольких переводчиков. Для проведения карательных операций, конвоирования были приданы взвод солдат СС и местные полицейские.

В Брянске, Борисове и Орле команда имела спецлагеря для содержания арестованных. В Борисове лагерь размещался близ лесопилки, и в нем содержалось одновременно до 600 человек. В том же городе с марта по май 1944 г. функционировали курсы подготовки агентов под руководством Владимира Жуковского. Закончившие курсы, засылались в партизанские отряды и работали на контрразведку в лагерях военнопленных.

Помимо ведения агентурной работы сотрудники органа фильтровали военнопленных и гражданских лиц в лагерях, выявляя партийных, комсомольских лидеров и комсостав, уничтожая их в автомобилях-душегубках.

Форкоманда «Москва» была создана в начале июня 1941 г. и двигалась в восточном направлении вместе с частями 4-й танковой армии. Командой последовательно руководили: начальник VII управления РСХА штандартенфюрер СС профессор Зикс Франц Альфред (1941), штурмбанфюрер СС Клингельхофер Вольдемар (1941), оберштурмфюрер СС доктор Кертинг Эрих, штурмбанфюрер СС Бухардт Фридрих (1941), штурмбанфюрер СС Бок Вильгельм (1941–1942), гауптштурмфюрер СС Шмуклер (1942), штурмбанфюреры СС Блюм Вильгельм (1942–1943) и Экхардт Ханс (1943).

Зондеркоманда «Москва» продвигалась по маршруту Рославль-Юхнов-Медынь-Мало-ярославец, имея задание ворваться с передовыми немецкими частями в Москву и произвести захват важных объектов.

После разгрома немцев под Москвой зондеркоманду отвели в г. Рославль и в 1942 г. реорганизовали. После реорганизации орган стал именоваться «Зондеркоманда-7Ц». В сентябре 1943 г., после участия в кровопролитных боях с наступающими советскими войсками, команду вывели с фронта в м. Колотиничи и расформировали.

Айнзатцкоманда 8. Придана группе армий «Центр». Начальниками органа последовательно были: штурмбанфюреры СС доктор Брадфиш Отто (1941–1942), Рихтер Хайнц (1942), Иссельхорст, Шиндхельм Ханс (1942–1944), Рендорфер Альфред. Командой уничтожены свыше 20 тысяч человек.

Айнзатцкоманда 9. Айнзатцкоманду 9 последовательно возглавляли: оберштурмфюрер СС доктор юриспруденции Фильберт Альфред (1941), штурмбанфюреры СС Шеффер Освальд (1941–1942), Вибенс Вильгельм (1942–1943), доктор Бухард Фридрих (1943), Кемпф Вернер (1943–1944).

Районом действий формирования стали тыловые области немецкой армии в Белоруссии. Помимо обычной работы, присущей большинству аналогичных подразделений, команда занималась созданием белорусских воинских формирований.

При штабе органа находились 200 штатных агентов. Для проведения расстрелов, арестов и конвоирования имелся взвод солдат СС (25–30 человек).

В Витебске при команде были организованы курсы для полицейских под названием «Шуцманкомпани». Начальником курсов был некто Нейфорт. Курсы готовили агентов для внедрения в партизанские отряды и ведения провокаторской работы среди местного населения.

В течение июля 1941 г. команда оперировала в районах г. Лиды и Вилейки, затем через Витебск, Смоленск и Вязьму продвинулась до Гжатска. В конце 1941 г. команда вернулась на длительное время в Витебск. Подразделения органа дислоцировались в Витебске, Смоленске, Невеле, Лепеле, Сураже, Борисове, позднее в Полоцке, Городке, Демидове, Бешенковичах и Дубровно.

При Лепельском отряде команды также функционировали двухмесячные курсы по подготовке разведчиков для их внедрения в партизанские отряды. На курсах обучалось 50 диверсантов.

С ноября 1943 г. штаб команды находился в Полоцке, в июне 1944 переехал в г. Августов (Польша), в марте 1945 г. весь орган передислоцировался в Кенигсберг. В Восточной Пруссии команда участвовала в создании и подготовке групп «Вервольфа». Командой уничтожено свыше 11 тыс. человек.

Перед началом военных действий находилась в Кракове, затем выдвинулась в район Львова и Стрия и вместе с передовыми частями начала продвижение в глубь Украины.

Начальниками органа последовательно были: бригаденфюрер СС и генерал-майор полиции, доктор Раш Отто, с ноября 1941 г. — бригаденфюрер СС и генерал-майор полиции доктор Томас Макс, одновременно возглавлявший полицию безопасности и СД Украины.

Задачи, методы работы и структура органа соответствовала вышеупомянутым аналогам.

После захвата Киева в украинскую столицу прибыл штаб зондеркоманды 4А. После этого началось создание широкой агентурной сети из местных жителей. В контрразведывательной работе был задействован ряд оккупационных организаций. Так, при немецком комиссаре г. Киева под вывеской управления кадров «Персональамт» был создан замаскированный орган контрразведки во главе с местным жителем, немцем по национальности Боссом Артуром. Орган размещался в одном здании с городской управой и был известен среди киевлян как отдел кадров управы, занимающийся учетом и распределением рабочей силы по киевским предприятиям. В действительности, эта организация вела агентурную контрразведку, следствие по делам арестованных. Часть арестантов и наиболее заинтересовавших разведку лиц передавали в полицию безопасности и СД.

«Персональамт» состоял из двух секторов — секретного и агентурно-информационного. Секретный сектор проводил негласную проверку рабочих и служащих через руководство учреждений и предприятий, вел специальную картотеку с их характеристиками. Агентурно-информационный сектор состоял из агентурно-оперативной команды, следственной группы и особой группы, занимавшейся установлением лиц и организацией наружного наблюдения.

Командой уничтожены свыше 118 тыс. человек.

Зондеркоманда 4А. Зондеркоманда 4А была придана 6-й армии южной группировки немецких войск. Начальниками органа последовательно были штандартенфюрер Блобель Пауль (1941–1942), штурмбанфюреры СС доктор Вейнман Эрвин (1942), Штеймле Ойген (1942–1943), Шмидт Фридрих (1943), Христенсен Теодор (1943).

В октябре-ноябре 1941 г. зондеркоманда находилась в Клеве, в декабре выбыла в Харьков. В 1942 г. отряды команды действовали в Фатеже, Миллерове, Новом Осколе. Основная часть органа прибыла в июне 1942 г. в г. Волчанск, где устроила массовое истребление граждан. В июле выбыла в Курск и Короч, затем в Воронеж. В октябре 1942 г. команда вернулась в Курск, где пробыла до 1943 г. Отсюда отряды команды высылались в Фатеж, Новый Оскол, Миллерово, Россошь.

В феврале 1943 г. команда выехала в Киев, оттуда направилась в Чернигов для проведения карательных акций против партизан.

Личный состав команды организовывал и принимал участие в массовом уничтожении жителей Киева в Бабьем Яре. Их жертвами стали свыше 33 тыс. человек.

Зондеркоманда 4Б. Зондеркоманду 4Б последовательно возглавляли штурмбанфюреры СС Герман Гюнтер (1941), Брауне Фриц (1941–1942), Хенш Вальтер (1942), Майер Август (1942), Зур Фридрих (1942–1943), Краузе Вольдемар (1943–1945). Командой уничтожено свыше 6 тыс. человек.

Айнзатцкоманда 5. Органом последовательно руководили оберфюрер СС Шульц Эрвин (1941) и штурмбанфюрер СС Майер Август (1941–1942).

Командой уничтожено свыше 46 тыс. человек.

Айнзатцкоманда 6. Действовала в тыловых районах немецкой армии. Начальниками команды последовательно были штурмбанфюреры СС доктор Крогер Эрхард (1941), Мор Роберт (1941–1942), Биберштейн Эрнст (1942), Зур Ф. (1942–1943).