Вскоре после полудня 8 июня Маршалль приказал крейсеру и эсминцам следовать в Тронхейм для помощи находившимся там немецким кораблям. Поэтому «Хипперу» не удалось поучаствовать в драматическом уничтожении «Глориеса». Следующий день крейсер простоял на рейде Тронхейма, куда ночью прибыли также оба линкора. 10 июня командир соединения принял решение нанести второй удар по британских перевозкам. Но в зоне действия более не оставалось никаких целей — английские конвои с эвакуировавшимися войсками отошли к своим берегам. От командования группой «Запад» поступили данные, свидетельствующие о наличии в районе значительных британских сил, а лично с «Хиппера» заметили погружающуюся подлодку. Все это заставило Маршалля отказаться от операции и вновь вернуться в Тронхейм вечером 11 июня. Немцам предстояло решить проблему с возвращением домой поврежденного торпедой «Шарнхорста». Для его прикрытия новый командующий флотом вице-адмирал Лютьенс решил выйти из норвежского порта на «Гнейзенау» с «Хиппером» и «Гальстером» и произвести диверсию против британских вспомогательных крейсеров (немцам было известно о наличии линии их патрулирования к югу от Исландии). Простояв в Тронхейме 9 дней, поздно вечером 20 июня маленький отряд вышел из порта и направился внутренними норвежскими водами на север.

Путешествие оказалось недолгим. Около полуночи (по немецкому времени) английская подводная лодка «Клайд» торпедировала «Гнейзенау». Хотя линкор не потерял боеспособность, но принял много воды, и отряд вновь вернулся в Тронхейм. Теперь поврежденными оказались оба линейных корабля. «Хиппер» остался единственной серьезной боевой единицей Германии в водах северной Норвегии. Сам крейсер оставался на якоре в порту Тронхейма, но его самолеты продолжали патрулирование прилегающих вод. 26 июня находившийся в противолодочном дозоре «Арадо» обнаружил и атаковал с высоты 300 м двумя 50-кг бомбами подводную лодку. Экипаж самолета наблюдал все признаки потопления и получил в награду Железные кресты, но на самом деле британская ПЛ «Тритон» успела погрузиться и ушла неповрежденной.

27 июня все еще находившийся в Норвегии «Хиппер» получил задание на выход в океан для борьбы с британским судоходством. На сей раз крейсеру предстояло действовать на просторах Атлантики в одиночку (для обеспечения его действий выделялись танкеры «Дитмаршен» и "Нордмарк"). Впрочем, у командования флота вызывала серьезные сомнения возможность корабля, уже предназначенного для среднего (месячного) профилактического ремонта, продержаться 2–3 недели в открытом море без существенных поломок механизмов. Все же решено было рискнуть, хотя настоятельно рекомендовалось вести крейсер на малой скорости, по возможности имея под парами только часть котлов. Такое решение, учитывая капризность механизмов крейсера, являлось довольно опасным, однако по мнению командования флота возможность «расшевелить» англичан в критический момент перевешивала риск.

Покинув 27 июня в 18 часов Тронхейм, «Хиппер» на короткое время встретился с «Гнейзенау», "Нюрнбергом" и 4 эсминцами, уходившими на родину, и направился на север. Океанский дебют оказался на редкость неудачным. Хотя крейсер интенсивно использовал для разведки оба своих гидросамолета, в течение 10 суток удалось обнаружить только 2 судна. Первое, финское, пришлось отпустить, поскольку запрещенных грузов на нем не было, а Финляндия не находилась в числе противников Германии. Но вот сухогруз "Эстер Торден" (1940 рег.т.) был оправлен в Тромсё в качестве приза. Хотя пароход принадлежал нейтральной стране (все той же Финляндии), на нем вместо заявленного груза обнаружили контрабандную целлюлозу и… почти 2 тонны золота. Полеты корабельной авиации в условиях северной Атлантики оказались недолгими. Один из самолетов перевернулся при приводнении (его пришлось потопить из корабельных автоматов), а второй пропал без вести (потеряв свой корабль, он все же достиг Норвегии). Оставшись без воздушной разведки и жестоко страдая от обледенения, «Хиппер» запросил у командования группы «Запад» разрешения возвратиться. Это разрешение было получено днем 6 августа, и через 5 дней корабль вернулся в Вильгельмсхафен, благополучно миновав на большой скорости все воздушные дозоры англичан.

После возвращения домой крейсер первым делом отправился в док в Киле, где провел остаток августа. Однако отдых был недолгим: командование Кригсмарине весьма рассчитывало на скоростные качества «Хиппера» и настоятельно хотело видеть его в качестве океанского рейдера. 24 сентября он вновь покинул Киль в эскорте "прерывателя заграждений" и 4 миноносцев, которые должны были вывести его в Северное море. Теперь кораблем командовал капитан цур зее Майзель. В этом походе перед крейсером стояла весьма интересная задача: отвлечение максимального числа британских кораблей для того, чтобы открыть дорогу десанту в район Северной Англии в рамках планировавшейся операции «Зеелеве». И хотя высадка десанта, как и вся операция, была отменена еще до выхода «Хиппера» в море, задание, данное крейсеру, осталось прежним.

Однако поход оказался сорванным сам собой — из-за капризов машинной установки. "Адмирал Хиппер" еще не успел выйти в Северное море, как сломался насос водяного охлаждения турбины правого борта. Майзелю пришлось отправиться в норвежский порт Кристиансанн, куда он и привел свой корабль вечером 25 сентября. Ремонт занял почти двое суток. Вновь выйдя в море и взяв курс на северо-запад, крейсер попал в полосу особо плохой погоды. И тут в полной мере сказались недостатки корабля в мореходных качествах. При полных оборотах он мог развить не более 27 узлов; носовая часть полностью заливалась водой, а работа штурманов в их рубке стала почти невозможной. К 10-балльному ветру добавились "внутренние болезни". В магистрали подачи смазочного масла к турбине высокого давления правого борта возник пожар. Для отсоединения передачи этой турбины от вала и ликвидации огня пришлось на 4 часа остановить корабль в бушующем море. Операция прошла успешно, но правый вал пришлось разъединить с редуктором. «Хромой» крейсер вынужден был прервать операцию и 25-узловым ходом направился в Берген. Экстренный ремонт позволил спустя некоторое время вновь ввести в действие правую турбину, но Майзель решил не рисковать и поступил очень мудро: на обратном пути в Германию дефект проявился снова. Операция закончилась полной неудачей; единственным «достижением» можно считать то, что крейсер вообще уцелел, чему в немалой степени помогла отвратительная погода.

30 сентября «Хиппер» прибыл в Киль и провел весь октябрь на заводе "Блом унд Фосс" в Гамбурге, где, наконец, окончательно исправили его правую турбину. 28 октября он перешел по Кильскому каналу в безопасную Балтику для обычных упражнений и послеремонтных испытаний. 17 ноября крейсер вернулся в Киль, где его вновь поставили в док для окончательной «доводки» к новому походу. 25 ноября он покинул док в боевой готовности, имея полный запас топлива, боеприпаса и провианта.

Третья попытка выхода «Хиппера» на океанский простор была связана с разведданными о британских конвоях, накопившихся к этому времени у германского морского командования. Средняя часть Атлантики, лежащая на линии Ньюфаундленд — Брест, являлась зоной пересечения сразу двух транспортных путей: из Канады и африканского порта Фритаун. По ним перевозились важнейшие стратегические грузы и войска. Единственным свободным скоростным кораблем, способным выбрать нужный способ действий против охраняемого конвоя — атаковать или уйти, был «Хиппер». Его командиру был дан "карт бланш" в отношении конкретных решений. Обслуживание операции осуществляли танкеры «Дитмаршен», "Фридрих Бреме" и "Торн".

Выход крейсера предполагался 28 ноября, но его пришлось отложить на двое суток, поскольку прогноз погоды обещал слишком хорошую видимость в Северном море. В последний день ноября «Хиппер» наконец вышел в поход, идя большой скоростью (25–27 узлов). Заправившись с танкера «Воллин» у норвежских берегов, он беспрепятственно достиг Северного полярного круга 2 декабря. Здесь ему вновь пришлось заправиться с танкера «Адрия», причем это занятие продолжалось с перерывами 3 дня — 2-го, 3-го и 5 декабря. Наконец, 5 декабря Майзель получил разрешение группы «Север», в зоне действий которой находился сейчас его корабль, на полностью самостоятельные действия.