Иван IV с детства не доверял боярам. Подозрительность его усилилась и после того, когда царь, опасно заболев, ожидал, что они присягнут его маленькому сыну Дмитрию. Большинство Думы приняло сторону князя Старицкого, двоюродного брата Ивана IV. А это в случае смерти царя грозило новой междоусобной войной. Можно сказать, что по выздоровлении Ивана IV она и разразилась, хотя и в неожиданной форме: царь сам повел ее против всей страны. Он обвинял родовитую знать в cношениях с Литвой, в намерении отъезда туда, в злоумышлении на царя и других неблаговидных помыслах с его точки зрения. Пострадали даже люди из его ближайшего окружения: Адашев был послан в Ливонию, где умер, а Сильвестр — в Соловецкий монастырь. Опасаясь за свою свободу и жизнь, бежал в Литву князь Курбский.

В декабре 1564 г. Иван IV пошел на необычный шаг: он внезапно покинул Кремль, взяв с собой жену, ближних людей и слуг, а также имущество, казну и святыни. Остановился он в Александровой слободе — дворце, построенном между Троице-Сергиевым монастырем и Ростовом. Отсюда он послал москвичам две грамоты, в которых отказывался от правления. Причиной своего решения он называл своеволие бояр, своекорыстие и заговоры («умышление на государя»). В Москве не ждали такого шага от государя, и первой реакцией были испуг и растерянность — люди не представляли себе жизни без царя. В Александровскую слободу была отправлена делегация с нижайшей просьбой о возвращении и с гарантиями полной поддержки: «А хто будеть государьских лиходеев и изменников, и они за тех не стоят и сами тех потребят» (уничтожат). В ответ царь выставил условия. Он требовал диктаторских полномочий, свободы «опалы свои класти а иных казнити и животы остатки имати их» и создания особого царского аппарата управления: «а учинити ему в своем государстве опричнину, двор ему свой на весь свой обиход учинить особый».

Страну разделили на две части. Опричные земли (дворцовые села и слободы; города на западной границе, на богатом торговом Севере и в центре страны) с населением Иван IV (в опричнине он звался не царем, а князем московским) взял под свое управление. В его новой столице — Александровой слободе — находились его двор, дума, приказы. Была в опричнине и «опричная рать». В Москве, часть которой тоже попала в опричнину, Иван IV возвел за рекой Неглинной огромный замок, Опричный дворец, противопоставлявшийся Кремлю. Другой частью государства — земщиной — управляли прежняя Боярская дума и приказы. Здесь ненадолго появился даже свой правитель — князь Симеон Бекбулатович (марионеточный хан небольшого Касимовского ханства на нижней Оке, «назначенный» на время царем Руси). Но на самом деле раздела страны не произошло: всю территорию земщины и ее органы власти жестко контролировал опричный аппарат.

На создание опричнины и на войну в Ливонии царь взял с земщины гигантскую сумму, а затем с помощью опричного войска начал грабить собственную страну. Жесточайшая личная диктатура и террор, главные методы введения нового невиданного порядка, вызывали ужас у современников. Царь посягал на свободу, жизнь и имущество каждого, в ком видел противника. Опричники разъезжали по стране, муча и убивая простых земских людей, крестьян и горожан. Были испробованы все известные и вновь изобретенные виды пыток и мучений. Никто не чувствовал себя в безопасности: казни и пытки грозили даже высшему священству — по приказу Грозного был смещен и убит митрополит Филипп, выходец из рода бояр Колычевых. У каждого опричника к седлу были прикреплены собачья голова и метла (знак «выгрызания» и «выметания» измены). Народ звал их кромешниками, играя на сходном смысле слов опричь и кроме, а царя — Грозным. Так называли когда-то его деда, но внуку это прозвище подходило гораздо больше.

Пик террора пришелся на начало 1570-х гг. За «измену» подвергали наказанию целые города. Главными жертвами стали богатые Тверь, Новгород и Псков. Грозный пошел на них настоящим военным походом. Новгород окружили; игуменов окрестных монастырей пытали и многих казнили, а архиепископа сослали. Опричники упорно «трудились» более месяца, грабя и убивая новгородцев, лишь после этого была «явлена милость». Сохранились воспоминания, что вода в Волхове стала красного цвета — так много было пролито крови. В Пскове массовых казней не было — во время торжественной встречи царя местный юродивый протянул Грозному кусок сырого мяса. Намек на кровожадность Ивана IV был слишком прямолинейным. Выходка убогого могла повлиять на непредсказуемый и жестокий характер Ивана, но псковичи, знавшие о чудовищных событиях в Новгороде и устрашенные его участью, поспешили сами отдать все, чего потребовал царь.

Вернувшись из «победоносного похода», Грозный недолго сохранял опричнину. Задуманный переворот был завершен, власть окончательно сосредоточилась в руках царя, и в опричнине он больше не нуждался. Кроме того, оказалось, что террором невозможно добыть денег. При бесконечных конфискациях их в стране становится не больше, а меньше (с середины 1550-х гг. пришлось даже отказаться от строительства каменных храмов и крепостей). Опричнина вызвала негодование и возмущение всех слоев, а также осуждение за рубежом. К тому же часть ее лидеров заподозрили в измене, и они были казнены. Кроме того, выяснилось, что война с собственным народом плохо сказывается на боеспособности. В 1571 г. опричное войско не сумело отразить набег Девлет-Гирея, и вся Москва вместе с Опричным дворцом была сожжена (в чем суеверный Грозный мог увидеть знак высшей воли). Пришлось доверить дело земскому полководцу из числа самых родовитых, князю Воротынскому, который и организовал успешную оборону южного рубежа.

В ходе опричнины царь сокрушил главную опору средневекового устройства — систему местных связей.

Массовые «переводы» горожан, землевладельцев и крестьян оборвали невидимые нити, на которых держалась жизнь удельной Руси. Все сферы, включая религию и хозяйство, подчинились одному центру и воле самодержца. Он стал всевластным.

«Нынешний великий князь достиг того, что по всей русской земле, по всей его державе, один вес, одна мера! Только он один и правит. Все, что ни прикажет он, все исполняется, и все, что запретит, действительно остается под запретом. Никто ему не перечит, ни духовные, ни светские», — писал иностранец-опричник Генрих Штаден.

Опричный террор и непомерные военные расходы разорили страну. Ее хозяйство развивалось теперь только «вширь», за счет приобретения новых земель. Прирост населения не поспевал за увеличением территории, а система «службы с земли» требовала все больше работников. Это постепенно вело к закрепощению.

Попытка Ивана IV быстро создать аппарат, годный для управления гигантской страной, обернулась трагедией для России. Один из иностранцев писал: «Столь низкая политика и варварские поступки так потрясли все государство и до того возбудили всеобщий ропот и непримиримость, что это должно окончиться не иначе, как всеобщим восстанием».

Вскоре предсказания начали сбываться. Средневековая Русь лежала в руинах. Чтобы исправить тяжелейшую ситуацию и подготовить почву для превращения страны в европейское государство потребуется еще целое столетие. России придется пережить не одну гражданскую войну, потратить усилия нескольких поколений и сменить правящую династию.

Но все же созданное в конце XV–XVI вв. Московское, или Российское, государство окажется внутренне прочным и способным к изменениям. Многие начинания эпохи Ивана Грозного в дальнейшем получат развитие. Продвижение на Восток приведет русских первопроходцев к берегам Амура и Тихого океана. На Западе будет продолжен начатый процесс «отвоевания» территорий, входивших когда-то в Киевскую Русь.

Однако дальнейшее закрепощение крестьянства и обострение конфликтов между правящей верхушкой, массой служилого люда и горожанами приведет к частым бунтам, казацким и стрелецким восстаниям, мятежам. Так русские люди в эпоху, когда не было ни средств информации, ни выборов, получали возможность участвовать в выборе дальнейших путей развития страны. В этом постоянном «социальном кипении», почти незнакомом предшествующим векам, суть истории Российского государства XVII в.