Для Зидана же сезон завершился на операционном столе. 12 мая в одной из клиник Страсбурга ему делают операцию по поводу мениска на больном колене. Операция прошла успешно. По заявлению медперсонала, на восстановительный период уйдёт полтора-два месяца. По меньшей мере, шесть недель Зидану запрещено вообще иметь дело с мячом, а появиться на футбольном поле, по предварительным прогнозам, он мог только в конце июня. Вспоминая об этом периоде своей жизни, Зинедин скажет:

«Я был опустошён и думал только об отдыхе. Морально он был мне необходим»…

Первый тренировочный сбор в новом сезоне «Ювентус» начал непривычно рано — 3 июля. Главной причиной столь раннего начала стал провал клуба в прошлом сезоне. В итоге, новый сезон на международной арене «Ювентус» начал там, где клубу с таким именем не место по определению — в Кубке Интертото. Ничего не поделаешь, если ты скатился с вершины, подъем надо возобновлять с самого низа. Однако возвращение самого Зидана в большой футбол было отложено. Он поспешил с возвращением к тренировкам, и прооперированное колено дало о себе знать. В его отсутствие «Ювентус» успешно шествует в Кубке Интертото 1999 года, но Зидан успевает принять участие лишь в двух финальных матчах против французского «Ренна» — 2:0 и 2:2. Эти матчи означали возвращение Зинедина в большой футбол после трехмесячного перерыва. Возвращение вышло неплохим: Зизу поучаствовал в одной из голевых комбинаций, а его клуб, посредством победы в Кубке Интертото, завоевал право участия в Кубке УЕФА наступающего сезона.

Теперь настало время выручать и сборную, попавшую в довольно щекотливое положение в отборочном турнире. За время отсутствия Зидана чемпионы мира умудрились проиграть на «Стад де Франс» России — 2:3, и с превеликим трудом одолели Андорру — 1:0. В итоге, к осени 1999 года, выяснилось, что сразу четыре сборные претендовали на два первых места в группе. Первое давало прямой пропуск на Чемпионат Европы 2000 года, а второе давало шанс побороться за право попадания туда через плей-офф. «Трехцветным» предстояли выезды в Киев и Ереван. Особенно важным выглядел матч с украинцами, проигрыш в нем явился бы для французов катастрофой. Положение усугублялось тем, что не набрал ещё должных кондиций после операции Зидан, пропускал встречу из-за дисквалификации Дюгарри, были травмированы Пети и Богоссян, да к тому же и остальные игроки ещё только начали втягиваться в сезон.

Все эти обстоятельства в какой-то мере уравнивали шансы сторон. В этой обстановке Лемерр впервые за время своего руководства сборной идёт на вариант с тремя опорными хавбеками, дабы максимально снизить процент риска. Не собирались рисковать и украинцы, а потому, как и предполагалось, открытого и зрелищного футбола публика не увидела. Тон в игре задавали гости. С помощью прессинга и превосходства в центре поля им удалось завладеть территориальным преимуществом, но при этом голевые моменты возникали крайне редко. Игра все больше напоминала решение задачи по ограничению доступа к вожделенному объекту, а после реализации этого плана — перевода его в освободившуюся зону, где мяч и должен был двигаться к воротам. Но за доступ к мячу снова разгорались ожесточённые бои, и так практически весь матч. Что касается игры Зидана, то она получила довольно высокие оценки. Вариант с тремя опорными хавбеками разгрузил его для конструктивных действий. Зизу раздавал такие передачи, что просто дух захватывало. Вот только продолжения они чаще всего не получали, но это уже вопрос к его партнёрам. Кроме того, лучший игрок мира был полезен и тем, что отвлекал на себя сразу нескольких соперников, в том числе и Гусина с Максимовым, которым приходилось больше внимания уделять обороне, вместо того, чтобы задавать направление атакам своей команды. Активно участвовал Зинедин и в обороне: при опасных ситуациях он смещался влево и вместе с Лизаразю перекрывал кислород Лужному, если тот пытался пройти по флангу. Конечно, пока он ещё не был должным образом подготовлен функционально, а потому его действиям не хватало движения. Но в целом Зидан оставил очень хорошее впечатление, словно не было в его карьере трехмесячного простоя из-за проблем с коленом. Правда, идеального результата достичь не удалось, но и ничья — 0:0, оставляла шансы. Только теперь нужно было обязательно побеждать в двух оставшихся матчах, но и это условие не было гарантией победы в группе, нужно было ждать в последнем туре благоприятных известий из Москвы, где чемпионам мира желательна была ничья в матче Россия — Украина.

В Ереване «трехцветные» уже на 7-й минуте пропустили мяч в свои ворота. Но затем без видимых усилий переломили ход игры, в которой блистали Джоркаефф и Зидан, который мастерским низовым ударом с линии штрафной после перерыва вывел гостей вперёд. Чемпионы мира выиграли со счётом 3:2, но перед последним туром по-прежнему шли на третьем месте. Итак, все должно было решиться в последний момент, но драматические события, происходившие 9 октября в Москве и Париже, превзошли самые смелые ожидания.

Надо сказать, что обстановка во Франции перед последним матчем со сборной Исландии была довольно нервозной. Лемерр не мог использовать нескольких футболистов, пресса напоминала, что хозяева традиционно трудно играют с командами, исповедующими тотальную оборону, а исландцы, между тем, по ходу турнира ни разу не пропустили более одного мяча за матч, да и к тому же психологически были раскованы, будучи избавленными от необходимости достижения положительного результата любой ценой. Наконец, нервировало и то обстоятельство, что судьба первого места решалась, прежде всего, в Москве.

Но, в конце концов, опасения прессы по поводу малоэффективности французской атаки не оправдались. К перерыву «трехцветные» вели 2:0, упустив при этом ещё кучу моментов, а в Москве по-прежнему сохранялась нулевая ничья. В этот момент «трехцветные» возглавляли группу. Однако после перерыва в Париже началось твориться невероятное. При, казалось бы, большом преимуществе в игре хозяева умудрились позволить исландцам за 10 минут сравнять счёт! Ничейный результат в Париже выводил на первое место Украину, на второе место перемещалась Россия, а сами чемпионы мира на 15 минут оказались вне финального турнира. Разумеется, французы сразу же пошли на штурм и на 71-й минуте добились-таки своего. Это Зидан подал угловой, после которого Дезайи нанёс мощный удар головой; голкипер хоть и парировал удар, но первым к отскочившему мячу успел Трезеге, вновь выведя хозяев вперёд.

Ситуация в группе поменялась в третий раз, вознёсся «трехцветных» на самую вершину. Через четыре минуты россияне открывают счёт в Москве и в течение 12 минут пребывают на первом месте, оттеснив французов на второе. В Париже концовка матча выдалась крайне нервной — хозяева много атаковали, опять имели немало шансов, Джоркаефф, наконец, забил, но рефери во второй раз в этом матче не засчитал гол французов. Исландцы больше почти не имели голевых шансов. Но момент, когда Лама не удержал мяч и упал на него телом, дав гостям шанс попытаться выбить мяч из-под него, едва не довёл Францию до инфаркта. А на 87-й минуте ситуация в группе изменилась в пятый раз, когда украинцы сравняли счёт в Москве — 1:1, и вышли на второе место в группе.

На этом оба матча завершились. Чемпионы мира, как и предполагалось на старте, сумели стать победителями группы и выйти в финальный турнир чемпионата Европы. Однако обстоятельства, при которых это произошло, не располагали к излишней эйфории. Фраза «Слава Богу, прошли!» была лейтмотивом высказываний французской прессы сразу по окончании отборочной кампании. Конечно, как выяснилось по ходу турнира, французам, возможно и досталась самая сложная группа, в которой сразу четыре сборные претендовали на заветные два первых места. И, тем не менее, нулевая ничья в Париже с украинцами, которая едва не переросла в конце матча в поражение, нервная концовка матча с Арменией в Ереване, поражение на своём поле от России, вырванная лишь за пять минут до конца матча победа над Андоррой, 15-минутное пребывание вне чемпионата Европы 2000 года, по ходу домашнего матча с Исландией отнюдь не делали безоблачными перспективы чемпионов мира на полях Бельгии и Голландии будущим летом.