В 1525 г. Великий Магистр иоаннитов Виллье де л'Илль Адан посетил Париж, Лондон и Лиссабон и прибыл в Мадрид на аудиенцию к императору Карлу V. Великий Магистр просил для Ордена острова Минорку, Цитеру или Эльбу, но не получил их и вернулся в Рим. Возможно этому помешали военные действия между римским папой и императором, закончившиеся миром 1529 г. в Камбре.

В 1530 г. папа Климент VII обратился к Императору Священной Римской Империи Карлу V с просьбой даровать Ордену постоянную резиденцию на острове Мальта. Император благосклонно отнесся к этому ходатайству и 24 марта 1530 г. Карл V в Кастельфранко подписал грамоту, по которой острова Мальта, Комино и Гоцо, а также город и крепость Триполи в Ливии (важный стратегический пункт, захваченный еще в 1510 г. испанским флотом. — Авт.), передавался иоаннитам на вечные времена в виде дворянского свободного лена — feudum perpetuum, nobile, liberum, francum. Лен условно подчинялся вице-королю Сицилии.

Император желал, чтобы рыцари защищали его суда в Средиземноморье от атак турок и промышлявших здесь алжирских пиратов и помешали бы туркам открыть военные базы в Триполи. Орден же должен был в качестве символической платы за этот дар ежегодно поставлять Карлу V одного охотничьего сокола, в знак вечной признательности за щедрость [45].

Орден на Мальте. Мальтийский рыцарский флот. Войны с Турцией. Потеря Триполи. Великий Магистр Жан де Ла Валетт. Орден на Мальте в конце XVI–XVII веке. "Морской щит Европы". Мальтийский орден как суверен в Европе

В 1530 г. император Карл V навечно отдал Мальту иоаннитам на правах лена-феода, что было утверждено буллой римского папы Климента VII от 25 апреля 1530 г.

29 мая 1530 г. послы Ордена присягнули вице-королю Сицилийскому вассалу Карла V [46]. Орден стал именовать себя "сувереном Мальты".

26 октября 1530 г. члены Совета Ордена, только что утвердившие акт передачи рыцарям порта Триполи и острова Мальты, во главе с Великим Магистром Филиппом де Виллье де л'Илль-Аданом прибыли в столицу Мальты город Биргу, откуда орденские рыцари должны были защищать южное побережье Франции и Италии от постоянных набегов тунисских пиратов — братьев Хайруддина и Аруджа Барбаросс.

"Прибыв на Мальту 26 октября 1530 г. Великий Магистр с Советом и главнейшими командорами, по вступлении на берег, пошли прямо в церковь святого Лаврентия для принесения благодарения за покровительство небес; потом пустились искать себе пристойного жилища. При замке Святого Ангела, который составлял единственное укрепление на сем острове, было селение, состоявшее большою частью из рыбачьих шалашей. В сих хижинах должны были поместиться командоры и кавалеры.

Через несколько дней Великий Магистр принял во владение и столичный город, называемый по имени острова — Мальтою ж (имеется в виду Бирга. — Авт.). Сей город имел в окружности 1300 шагов" [47].

Флот Мальтийского ордена в 1530 г. состоял из четырех военных кораблей: знаменитой "Санта-Анны", трех галер — "Сан Джованни", "Санта Мария Витториозо", "Аквиллы" и нескольких кораблей гражданского назначения. Почти все галеры были уничтожены во время урагана на Мальте 23 октября 1553 г., но уже через пять лет флот Ордена снова состоял из галеона и четырех галер, три раза в год выходивших в крейсерское плавание по открытому морю. В эти же годы вход в Большую Мальтийскую Гавань от форта Рикасолли до форта Сент-Эльмо был закрыт железной цепью.

Борьба рыцарей во главе с генералом орденских галер приором Пизанским Ботиджелой с пиратами принесла рыцарскому флоту европейскую славу.

Тогда уже в Уставе Ордена появилось правило, что мальтийским рыцарем мог стать воин, не менее трех лет участвовавший в морских походах Ордена.

В 1535 г. флот иоаннитов совместно с испанскими кораблями совершил один из первых рейдов на алжирских пиратов Хайруддина Барбароссы. Начав поход из Сардинии и города Порто-Фарино, испанцы и рыцари осадили и взяли турецкую крепость Гулетту — арсенал Барбароссы, освободив около 10.000 христианских пленников и захватив 300 пушек и 87 галер. Штурмом был взят и разграблен город Тунис, в котором рыцари не остались, а вернулись домой.

Во времена Реформации произошли значительные изменения в структуре Ордена.

В 1540 г. в Англии король Генрих VII, яростно боровшийся с папским Римом, запретил деятельность Ордена на подвластной ему территории и конфисковал имущество английских госпитальеров (в Англии Орден был восстановлен указом королевы Виктории лишь спустя более 300 лет — в 1888 г.). Вместо английского "Языка" в структуре Ордена появилась Бавария.

В том же году магистр и рыцари бальяжа Бранденбург приняли лютеранство. Так в Пруссии была образована самостоятельная ветвь Мальтийского ордена, члены которого исповедывали лютеранство [48].

Осенью 1541 г. флот Ордена участвовал в походе тридцатитысячной армии Карла V на Тунис — опорный пункт североафриканских пиратов. На рейде Алжира испанскую флотилию разметала буря, потопив 15 больших галер и 86 других кораблей. Четыре галеры Мальтийского ордена уцелели и с остатками испанского флота вернулись домой.

В 1547 г. на Мальте ненадолго высадился турецкий отряд, который ограбил несколько селений и быстро покинул остров.

В 1551 г. турецкое войско напало и разграбило плохо укрепленные районы островов Мальта и Гоццо, при этом 6300 местных жителей были угнаны в рабство. Иоанниты начали укрепление островов и своей столицы Gitta notable. У входа в Большую гавань они выстроили форт Сент-Эльмо, заново отстроили форт Сан-Анжело, город Биргу, построили форт Сан-Микаэль для защиты нового города Сенглеа.

В 1551 г. турецкое войско на 112 галерах, 2 галеасах, 3 транспортных судах и бригантине, везших 12.000 солдат во главе с Синам-пашой, попыталось высадиться на Мальте, но было отброшено иоаннитами и ушло к Триполи замок, мужественно защищаемый рыцарским гарнизоном во главе с комендантом маршалом Ордена Гаспаром де Валлье, был взят.

Через девять лет галеры Мальтийского ордена совместно с испанцами участвовали в попытке возвращения этого важного стратегического порта в Северной Африке, но Триполи отбить не удалось.

21 августа 1557 г. Великим Магистром стал гасконец Жан Паризо де Ла Валетт, в тридцатилетнем возрасте участвовавший в защите Родоса во время осады армией турецкого султана Сулеймана. До избрания Великим Магистром де Ла Валетт был адмиралом мальтийского орденского флота.

Де Ла Валетт, знавший итальянский, испанский, греческий, арабский и турецкий языки, пригласил на Мальту знаменитого военного инженера Бальтазаре Ланчи, который занялся обновлением форта Сан-Анджело, укрепил крепости Биргу и Сенглеа и построил новые укрепления фортов Сан-Эльмо и Сан-Микеле. Был построен и новый большой госпиталь.

Флот Ордена насчитывал 8 галер. "С новым рвением продолжал Мальтийский орден, с этого времени, преследование африканских пиратов, чуть ли не ежедневно приводя в Большую гавань захваченные корабли с богатой добычей, так что морские силы Ордена развились небывалым образом" [49].